いきなりサーバー側のどこでもアップロードしていいわけではありません。 これもプロバイダごとに約束事が決められているので、プロバイダのHPをよく読んで下さい。
一般的に、開いた場所に、プロバイダの決めた名前のディレクトリを作成 する必要があります。(既に作ってくれているプロバイダもあります) プロバイダのホームページから調べてくるか、問い合わせてみましょう!
※正常に接続されていれば、右側のウインドウにディレクトリ構造が現れるはずです。 といっても、何もないかも知れないので、「..」だけかもしれません。